Департамент финансов
1) разработка и представление в уполномоченный орган по бюджетному планированию проекта республиканского бюджета Министерства на трехгодичный период, уточнение и корректировка показателей текущего финансового года;
2) утверждение (переутверждение) Бюджетных программ (подпрограмм) Министерства на трехлетний период и текущий финансовый год;
3) формирование и представление на рассмотрение в Республиканскую бюджетную комиссию инвестиционных предложений для включения в перечень приоритетных бюджетных инвестиционных проектов;
4) участие в разработке законопроектов, национальных проектов, подзаконных актов в области водных ресурсов и ирригации в части норм, регламентирующих увеличение доходной и (или) расходной части государственного бюджета
5) разработка и утверждение Правил по определению стоимости исследований, консалтинговых услуг и государственного задания;
6) разработка и утверждение Правил по определению экономического эффекта от бюджетных субсидий;
7) разработка и утверждение натуральных норм по согласованию с центральным уполномоченным органом по бюджетному планированию;
8) разработка, утверждение и согласование отраслевых нормативов численности работников, обеспечивающих техническое обслуживание и функционирование государственных органов в курируемых отраслях в порядке, установленном уполномоченным государственным органом по труду;
9) разработка предложений по совершенствованию законодательства по вопросам планирования;
10) в пределах компетенции обеспечение реализации, участие в разработке, проведении мониторинга и контроля Плана развития Министерства и программных документов Министерства и иных документов Системы государственного планирования в Республике Казахстан, а также внесение предложений по их совершенствованию;
11) разработка и представление в уполномоченный орган по бюджетному планированию проекта по уточнению или корректировке республиканского бюджета Министерства на текущий год;
12) при необходимости подготовка и утверждение штатного расписания центрального аппарата Министерства и согласование к утверждению штатных расписаний государственных органов Министерства;
13) разработка предложений по совершенствованию системы оплаты труда работников, содержащихся за счет государственного бюджета;
14) взаимодействие с уполномоченными органами в сфере бюджетного планирования, координация и методологическое руководство по указанным вопросам в Министерстве, его ведомствах и подведомственных организациях;
15) обеспечение принятия нормативных правовых актов по ценообразованию услуг области водных ресурсов и ирригации;
16) обеспечение принятия нормативных правовых актов по нормам специального автотранспорта в области водных ресурсов и ирригации;
17) в пределах компетенции разработка проектов документов, правовых и нормативно-правовых актов на государственном и русском языках;
18) осуществление иных функций в рамках данной задачи, возложенных в установленном законодательством порядке.